稅務風險

被追繳稅款及滯納金根據《企業所得稅優惠政策事項辦理辦法》等規定，企業享受研發費用加計扣除優惠時，需留存備查包括立項決議文件等在內的相關資料。若未準備這些資料，一旦被稅務機關查實，將面臨被追繳已多扣除的稅款，并按日加收滯納金的后果。

面臨罰款情節嚴重的，還可能被處以少繳稅款 0.5-3 倍的罰款。

信用受損風險

納稅信用等級降低納稅信用等級會被降為 D 級，進而影響發票領用、出口退稅、融資授信等多方面業務。例如，在融資時，銀行等金融機構可能會因此提高貸款利率或拒絕貸款。

招投標資格受限可能被列入稅收違法 “黑名單”，導致在參與招投標時因信用問題而失去資格。

優惠政策享受風險

無法享受后續優惠即使企業后續有了符合條件的研發項目，也可能因之前的違規行為，在一定期限內被限制享受研發費用加計扣除等稅收優惠政策。

刑事責任風險若企業主觀故意虛列研發費用、偽造立項報告等資料以騙取稅收優惠，金額較大且情節嚴重的，可能涉及《刑法》* 201 條逃稅罪，相關責任人將承擔刑事責任。

科技研發型企業日常研究開發活動的管理

研發項目立項管理

明確立項標準與流程制定企業內部的研發立項標準和流程，規定哪些項目符合研發方向和戰略目標，需提交詳細的項目計劃書，包括研發背景、目標、技術路線、預期成果等內容。經企業有權部門，如董事會等進行嚴格評審和決策，形成正式的立項決議文件。

項目編號與備案對每個立項的研發項目進行*一編號，并在企業內部的研發管理系統中進行備案登記，同時根據相關政策要求，到科技行政主管部門進行登記或備案，以便享受相關優惠政策時有據可查。

研發人員管理

建立研發人員檔案詳細記錄研發人員的專業背景、技能水平、工作經驗等信息，明確其在各個研發項目中的角色和職責，并將研發人員名單與立項項目進行關聯，以便準確核算人員人工費用。

研發工時統計與管理利用項目管理軟件或工時表等工具，要求研發人員記錄每日在不同研發項目上的工作時間，以此為依據合理分配人員薪酬到相應的研發項目成本中，確保人員人工費用的歸集準確無誤。

研發費用管理

設置輔助賬按照研發項目設置 “研發支出” 輔助賬，對各項研發費用進行明細核算，區分費用化和資本化支出，準確歸集人工費用、直接投入費用、折舊費用、無形資產攤銷、新產品設計費等各類研發費用，并按要求填寫《研發費用加計扣除優惠明細表》。

費用審核與控制建立嚴格的費用審批制度，對研發費用的支出進行事前、事中和事后的審核，確保費用支出的真實性和合理性，防止費用的浪費和不合理歸集。定期對研發費用的支出情況進行分析和評估，及時發現和解決費用異常問題。

研發過程管理

項目進度跟蹤建立項目跟蹤機制，定期對研發項目的進展情況、技術難題攻克情況、階段性成果等進行檢查和評估，及時調整項目計劃和資源配置，確保項目按計劃順利推進，同時記錄研發過程中的各種情況和問題，形成過程性文件，如項目進度報告、技術方案調整記錄等，為后續的研發費用核算和成果驗收提供依據。

質量控制與風險管理制定研發項目質量控制標準和風險管理制度，對研發過程中的各個環節進行質量監控，確保研發成果符合預期的質量要求。同時，識別和評估研發過程中可能出現的技術風險、市場風險、資金風險等，并制定相應的應對措施，降低風險對研發項目的影響。

研發成果管理

成果驗收與評價研發項目完成后，組織內部專家或外部專業機構對研發成果進行驗收和評價，出具項目結題報告、成果鑒定報告等，詳細說明研發成果的創新性、實用性、先進性以及對企業的價值和貢獻等，為研發費用加計扣除等優惠政策的享受提供有力支持。

知識產權保護及時對研發過程中形成的專利、商標、著作權等知識產權進行申請和登記，加強知識產權的保護和管理，充分發揮知識產權在企業技術創新和市場競爭中的作用，同時也可以作為研發活動真實性和有效性的證明資料。

資料收集與檔案管理

研發資料收集在研發活動的全過程中，指定專人負責收集和整理相關資料，包括項目計劃書、立項決議文件、研發合同、費用憑證、測試報告、研發人員名單及工時記錄、成果報告等，確保資料的完整性和準確性。

檔案管理與保存建立研發資料檔案管理制度，對收集到的資料進行分類、編號和歸檔，按照規定的保存期限進行妥善保存，一般研發費用加計扣除留存備查資料應從企業享受優惠事項當年的企業所得稅匯算清繳期結束次日起保留 10 年，以便在稅務機關檢查或企業內部審計時能夠及時提供相關證明資料。